El primer trasplantament de moll d’os de l’Estat va tenir lloc a Sant Pau el 22 de maig del 1976. Des de llavors, l’Hospital ha realitzat quasi 3000 trasplantaments i ha rebut el premi de l’Organització Nacional de Trasplantaments a la major activitat en aquest camp, amb uns resultats obtinguts equiparables als dels millors centres d’arreu del món. L’any passat es van realitzar a Sant Pau més de 130 trasplantaments.

L’Hospital també és referència en trasplantament de moll d’os pediàtric i és centre de referència en immunodeficiències.

És de destacar que el programa de trasplantament de Sant Pau va ser el primer en tota Europa que l’any 2001 va assolir l’acreditació d’excel·lència JACIE, similar a la implantada en els hospitals nord-americans.