En el Servicio de Microbiología del Hospital de la Santa Creu i Sant Pau, el diagnóstico de las enfermedades infecciosas se contempla bajo la perspectiva de las diferentes áreas de conocimiento de la Microbiología: bacteriología, virología, parasitología, micología, y el estudio de los antimicrobianos, que se han ido desarrollando de forma equilibrada. Existen facultativos con una formación específica en cada una de estas áreas. Así mismo, impera una visión integrada del diagnóstico sindrómico de las enfermedades infecciosas: gastroenteritis, infección urinaria, respiratoria, sepsis, etc., donde confluyen las diferentes áreas de conocimiento.

La actividad asistencial se agrupa en cuatro grandes áreas, donde el personal, tanto facultativo como técnico, rota por las diferentes secciones con objeto de asegurar su polivalencia. Esta estructura de funcionamiento, que cuenta con el apoyo de la supervisión y los propios facultativos, tiene como objetivo la formación continuada del personal técnico.

Además, la interrelación que el Servicio de Microbiología mantiene entre las actividades asistenciales, docentes y de investigación permite que el Laboratorio esté al día, tanto desde un punto de vista conceptual como tecnológico, y sea capaz de incorporar de forma rápida y eficaz los adelantos propios del área de la Microbiología.